Une des principales menaces d'extinction du guépard est la consanguinité : les individus encore vivants ont une très faible diversité génétique. Selon des études, à la suite d'une ère glaciaire intervenue il y a 10 000 ans, seules quelques familles ont survécu. Cela explique la faible diversité génétique actuelle qui rend difficile leur reproduction, même en captivité.